Besigye er også siktet for brudd på våpenloven. Den militære siktelsen kommer i tillegg til en sivil forræderisiktelse.

Besigye ble arrestert 14. november, og pågripelsen utløste de alvorligste opptøyene på flere tiår. Før arrestasjonen var det ventet at Besigye skulle bli den viktigste utfordreren til president Yoweri Museveni i valget om fire måneder.