Flere hundre tungt bevæpnede menn tok seg inn i byen søndag, uten at det ble løsnet skudd, ifølge øyenvitner. En lokal militsgruppe som er lojal overfor forsvarsministeren i den svake, somaliske overgangsregjeringen, valgte å trekke seg ut av Kismayo.

Mange av innbyggerne i byen har flyktet av frykt for at det kan bryte ut kamper, og ifølge FN har flere hundre av dem krysset grensa til Kenya.

At havnebyen er blitt overtatt av islamistene, er et nytt nederlag for overgangsregjeringen som holder hus i Baidoa, rundt 25 mil nordvest for hovedstaden Mogadishu.

Hovedstaden ble erobret av den islamistiske bevegelsen i juni, etter flere måneder med harde kamper.

Mogadishu var tidligere kontrollert av en gruppe krigsherrer med støtte fra USA.