Flytoget hadde en omsetning på 832 millioner kroner i 2012 og fikk et driftsresultat på 146 millioner. Selv om omsetningen har økt fra 814 millioner i 2011, er driftsresultatet noe svakere. I 2011 var det på 152 millioner kroner.

Omsetningen har økt med 2 prosent fra 2011. Antall passasjerer steg fra 5,9 millioner til 6,1 millioner, en økning på 2,8 prosent.

— Vi er veldig fornøyd med resultatet for 2012, som er et av våre beste år. Å ha fraktet over 6 millioner passasjerer, samtidig som vi økte punktligheten vår med 2 prosent og holdt kundetilfredsheten ved like på 96 prosent, er vi veldig stolte av, sier administrerende direktør Linda Bernander Silseth i Flytoget AS. Resultatet før skatt viser samme tendens som driftsresultatet. I 2012 viste bunnlinjen 150 millioner kroner, mot 153 millioner kroner i 2011. På kostnadssiden er det primært lønn og avgifter til Jernbaneverket som har økt.